Como toda teoria, essa foi feita através de uma mistura de suposições (achismo) e algo apresentado na história. Afinal você tem que achar que vai acontecer alguma coisa porque foi mostrado outra coisa.
Muitos vão concordar que vai acontecer um confronto entre o Naruto e o Sasuke, pelo papel de herói e vilão/anti-herói que eles possuem na história. Um tem que brigar com o outro, pela naruteza do personagem. O problema seria como aconteceria essa batalha. Essa teoria foi feita para preencher essa lacuna. É obvio que essa batalha seria no fim do shupuuden e inicio da nova temporada (http://misamane.wordpress.com/2008/05/10/naruto-3-logo-logo-sera/ )

ANTECENDENTES: que Madara está fazendo a cabeça do Sasuke contra Konoha todos estão sabendo. E de acordo com os andamentos da história e o papel do personagem (vilão/anti-herói, como preferir), ele vai acreditar em tudo o que Madara está dizendo e irá:
-entrar na akatsuki para auxiliar Madara no que ele está pretendendo, virando assim uma “aprendiz” dele, ou
-não entrar na akatsuki mas tentar acabar dom Konaha, sob orientação de Madara.
Em ambas opções, a captura da Kyuubi é fundamental. Se Jiraiya deixou o segredo de Pein para Naruto antes de morrer, seria porque ele sabe que se um dia houver a batalha Naruto vs Pein, Naruto poderia derrota-lo (e Jiraiya deu a dica justo para Naurto, enquanto podia dar para qualquer um outro)(é um clássico daquela coisa que, se alguma coisa apareceu na história, ela tinha que aparecer). Assim descarta a possibilidade de Pein pegar Naruto. Mas se alguém não acredita nisso (o que muitos não acreditam, nem eu creio muito), simplesmente Madara pode mandar uma ordem para Pein para retardar a captura. Assim poderá dar uma oportunidade para Sasuke poder capturar Naruto. Madara como vem acompanhando sasuke através de Zetsu deve saber da amazade deles, e vai mandar ele para abatalha para que, com a morte de Naruto, Sasuke consiga os “olhos sagrados”. Afinal Madara quer Sasuke poderoso para seus planos (que ainda ninguém sabe ao certo, mas algo haver com Konoha, cinzas, sangue e um monte com algumas carinhas explodido), e isso deve ser uma de suas prioridades.

A PORRADA: e assim por alguma artimanha do destino (certamente um plano bem planejado) Naruto e Sasuke se encontrarão. Longe ou aos arredores de Konoha, mas longe o suficiente. Isso seria para ninguém interferir, não para preservar a cidade. E então viria a parte EMOcionante: Sasuke fala que está com Madara, Naruto chora, Sasuke fala que odeia o naruto, Naruto chora e grita, Sasuke fala que odeia Konoha, Naruto chora e grita e parte para a porrada. Não sei como será a luta, mas acho que sei qual será o resultado.

DEPOIS:Há duas possibilidades viáveis para o resultado da batalha:
-vitória de Naruto: tenha certeza de uma coisa: depois de ouvir algumas de Sasuke, Naruto não vai mais querer colocar Sasuke dentro de Konoha, então simplesmente larga Sasuke derrotado (não morto). Naruto nunca iria matar seu amigo. Então Naruto iria treinar mais para derrotar Madara e convencer que Sasuke está errado, fazer ele ir para o light side.
-empate:seria um bom resultado para dar estrutura futura na história, a respeito de evolução do naruto. Na preimeira fase sasuke ganha, na segunda dá empate, na terceira Naruto ganha.

Por que sasuke não poderia ganhar? A vitória de Sasuke implicaria na morte de Naruto, e ah… nessa altura da história, o principal simplesmente não pode morrer. Ressucitação de novo seria muita burrice.